Да. Внеурочная на каникулах "дозволительна" и по ФГОС, и по СанПиН.
Для большей уверенности можно взять с родителей обучающихся заявление примерно с такой формулировкой: "В целях содействия реализации моих родительских прав на развитие индивидуальных способностей моего ребенка … ФИ, а также в целях создания условий для коррекции текущего уровня ее/ его .. образовательных результатов прошу ... организовать в период с … по … освоение моим ребенком … ФИ освоение программы курса внеурочной деятельности «…»