Образовательная организация вправе проводить беседы с ребенком без присутствия родителей. Порядок работы закрепите в локальном акте. Например, положении о совете по вопросам профилактики безнадзорности и правонарушений несовершеннолетних или любом другом. Федеральное законодательство требований к форме документа не устанавливает.

При опросе несовершеннолетних, не достигших 14 лет, по делу об административном правонарушении обязательно присутствие педагога или психолога (ч. 4 ст. 25.6 КоАП). Если вашего ученика опрашивают правоохранительные органы, выделите педагога или психолога, чтобы он присутствовал на опросе. Также нельзя проводить без согласия родителей любые виды обследований (психологических, психолого-педагогических) (п. 7 ч. 3 ст. 44 Федерального закона от 29.12.2012 № 273-ФЗ).